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醫(yī)學(xué)生物信息學(xué)3100A/B – 醫(yī)學(xué)生物信息學(xué)導(dǎo)論
涵蓋醫(yī)學(xué)生物信息學(xué)的一般主題,包括公共數(shù)據(jù)庫(kù)、生物信息數(shù)據(jù)格式、序列比較和比對(duì),以及下一代序列處理(映射、de novo組裝)。實(shí)驗(yàn)室介紹命令行界面、在Linux文件系統(tǒng)中工作以及利用開(kāi)源資源、批處理和實(shí)施生物信息學(xué)工作流程的基本概念。
醫(yī)學(xué)生物信息學(xué)4650F/G – 表觀基因組分析的計(jì)算方法
處理、分析和整合表觀基因組數(shù)據(jù)的生物信息學(xué)方法,即除了基因序列之外的額外基因調(diào)控信息。學(xué)生將介紹質(zhì)量控制、回歸分析、差異分析的最佳實(shí)踐,以及功能富集方法。數(shù)據(jù)分析主要使用R統(tǒng)計(jì)編程語(yǔ)言。
醫(yī)學(xué)生物信息學(xué)4750F/G – 傳染病的生物信息學(xué)
介紹生物信息學(xué)技術(shù)在傳染病研究和臨床/公共衛(wèi)生管理中的概念和應(yīng)用。學(xué)生將介紹傳統(tǒng)和下一代序列數(shù)據(jù)的基本分析方法、最大似然和貝葉斯推理原理、重建流行病學(xué)和進(jìn)化歷史、檢測(cè)適應(yīng)性以及分子流行病學(xué)。
醫(yī)學(xué)生物信息學(xué)4850G – 基因組數(shù)據(jù)分析
使用R統(tǒng)計(jì)編程語(yǔ)言進(jìn)行數(shù)據(jù)分析和可視化的基礎(chǔ),主要關(guān)注下一代測(cè)序(NGS)數(shù)據(jù)。主題包括:NGS技術(shù)基礎(chǔ);測(cè)序數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)格式和結(jié)構(gòu);使用R有效分析不同類(lèi)型的測(cè)序數(shù)據(jù)(RNAseq、ATAC-seq和ChIP-seq)。
醫(yī)學(xué)健康信息學(xué)4980E – 研討會(huì)和研究項(xiàng)目
醫(yī)學(xué)健康信息學(xué)榮譽(yù)專(zhuān)業(yè)的主要研究項(xiàng)目和每周研討會(huì)課程。包括:i)研究方法論的理論和實(shí)踐以及對(duì)研究文獻(xiàn)的批判性評(píng)價(jià),ii)由教師監(jiān)督的獨(dú)立研究項(xiàng)目,以及iii)研究提案的準(zhǔn)備和最終的研究項(xiàng)目報(bào)告寫(xiě)作。
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閱讀原文:http://cheshan.cn/news/18829_59.html
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